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Compétences et définitions

Les compétences du SSM concernent la Phylogénie moléculaire (supra ou péri spécifique) et la Génétique des Populations (échelle infra-spécifique).

Ces domaines de compétence s’étendent au programme international Barcode of Life et à la Biologie de la Conservation.

Un pôle est également consacré à la Cytogénétique.

• Phylogénie moléculaire : cette discipline a pour objectif de reconstruire l’histoire évolutive des espèces par comparaison des séquences de leurs gènes (ou de leurs protéines).

• Génétique des populations : cette discipline a pour objectif d’étudier les fréquences alléliques dans les populations naturelles. Les changements de fréquence des allèles sont un aspect majeur de l'évolution, la fixation de certains allèles conduit à une modification génétique de la population, et l'accumulation de tels changements dans différentes populations peut conduire au processus de spéciation.

• Barcode : le projet international Barcode of Life a été lancé en 2003 et a pour but de référencer l’ensemble des espèces vivantes sur la planète par une séquence d’ADN « barcode ». La variabilité d’une séquence d’ADN est alors utilisée comme les codes barres du commerce pour attribuer un spécimen à une espèce ou encore attribuer une forme juvénile et une forme adulte à une même espèce. Ce programme a de fortes implications en expertise taxonomique.

• Biologie de la conservation : cette discipline traite des questions de perte, maintien ou restauration de la biodiversité.

• Cytogénétique : discipline qui étudie les chromosomes à l’aide de techniques cytologiques.

PCR est l'acronyme anglais de "Polymerase Chain Reaction", réaction de polymérisation en chaîne. C'est une technique d'amplification enzymatique (par la Taq polymérase) qui permet, à partir d'un fragment d'ADN, d'obtenir un grand nombre de copies identiques de ce même fragment.

L’utilisation de marqueurs moléculaires en systématique et en biologie évolutive s’est généralisée, en particulier depuis l’invention de la PCR. L’analyse « moléculaire » (utilisation de séquences d’ADN de gènes codants ou non, nucléaire ou mitochondrial et chloroplastiques, de marqueurs microsatellites) permet de répondre aux questions de biogéographie, de phylogénie et classification des espèces, de taxonomie et de délimitation des taxons, d’étude des processus de l’évolution ou des questions de biologie de la conservation (biologie et génétique des populations). L’utilisation des microsatellites permet d’élucider les relations de parentés entre individus ou identifier les immigrants dans une population dans des problématiques d’écologie et de biologie de la conservation pour le suivi des espèces invasives.

Le SSM est équipé d’un séquenceur ABI 3130 (4 capillaires) qui sert à l’analyse des microsatellites et à la mise au point de nouveaux marqueurs moléculaires.