Ressources

Équipement matériel


L’équipement du plateau technique comprend un tomographe permettant des analyses en microfoyer et en nanofoyer. Il s’agit du modèle « v|tome|x 240 L » de la société GE Sensing & Inspection Technologies Phoenix X|ray. Il a pu être acquis par le Muséum grâce à un co-financement fondation Simone et Cina del Duca (Institut de France), Région Ile-de-France, CNRS et MNHN.

 

 

Le système dispose de deux tubes interchangeables (tube RX microfoyer 240kV/320W avec une détectabilité jusqu’à 1 µm et tube RX nanofoyer 180 kV/15W avec une détectabilité jusqu’à 500 nm). Le détecteur a une surface active de 400 × 400 mm avec une matrice de 20242 pixels (taille de pixel : 200x200µm). Par ailleurs, le large espace au sein de la cabine de radioprotection et le large manipulateur multi-axes permettent l'acquisition d'une grande variété de spécimens.

Traitement des données

Des formations individuelles aux méthodes de traitement des données d'imagerie sont proposées, pour plus d'informations, contactez Patricia Wils (E-mail : patricia.wils(a)mnhn.fr).

Le travail de post-traitement (analyse des images, segmentation, modélisation 3D, mesures, etc.) pourra être réalisé dans la salle d'atelier d'imagerie ASIM qui met à disposition des utilisateurs d'AST-RX des stations de travail performantes équipées de logiciels dédiés. Vous pouvez réserver une station de travail via http://www2.mnhn.fr/reservation_depf/login.php
(identifiant mnhn et mot de passe) puis en sélectionnant le domaine « Plateau ASIM».


La manipulation des images générées par le tomographe nécessite l'utilisation de logiciels adaptés. Des supports au format PDF sont disponibles au téléchargement ci-dessous :

  • logiciel Avizo 9.0 :
    - Site officiel de l'éditeur du logiciel.
    - Manuel pour Avizo : Télécharger le tutoriel en français de prise en main réalisé pour le post-traitement des données du CT-scan avec Avizo 7.
     
  • logiciel Fiji :
    - Site officiel du projet (nombreuses documentations disponibles en anglais).
    - Manuel pour FIJI : Télécharger le tutoriel en français de prise en main réalisé pour le post-traitement des données du CT-scan avec Fiji et ImageJ.
     
  • logiciel SPIERS :
    - Site officiel du package SPIERS (Serial Palaeontological Image Editing and Rendering System).
    - Manuel pour Spiers : Télécharger le tutoriel en français de prise en main réalisé pour le post-traitement des données du CT-scan avec SPIERS 2.14.

 

Ressources complémentaires


Un tutoriel pour vous permettre de créer pas à pas un fichier au format PDF 3D en utilisant des outils logiciels libres de droits ou gratuits (LaTeX, MikTek, MeshLab, Adobe Reader) est disponible ici :
Tutoriel réalisation d'un PDF 3D

Les principes de la tomographie à rayons X sont détaillés dans le document suivant :
Tomographie à Rayons X